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东北史研究是我院长期以来独具专长的专业研究方向，很早就在大学本科教学中开设了东北史课程，并成立了东北史研究室。老一代教师陆续撰写并出版了《近代东北史》（王魁喜等编写，黑龙江人民出版社1984年版）、《现代东北史》（常城等编写，黑龙江教育出版社1986年版）、《中国东北通史》（薛虹与吉林师范学院李澍田主编，吉林文史出版社1991年版）、《清代柳条边》（杨树森著，辽宁人民出版社1978年版）、《关东马贼》（田志和、高乐才著，吉林文史出版社1992年版）、《吉林建置沿革概述》（田志和与吉林省档案馆潘景隆主编，吉林人民出版社1990年版）等多部专著、教材，发表了一大批价值较高的学术论文，为我院东北史研究奠定了坚实的基础。
东北研究所成立后，在继承老一辈史学工作者求真务实、勇于开拓精神的同时，大胆创新，对研究方向进行了新的诠释和定位。首先，不囿于历史研究，而是历史、现实一并研究，将历史与现实有机结合起来。"东北研究所"不称之为"东北史研究所"，其要旨即在于此。东北研究所诸同仁，不仅从事东北史研究，而且还承担了一定的现实调研工作，既开拓了研究领域，又拓展了研究思路，历史研究与现实研究相得益彰。其次，将"东北"视作"边疆"，以"边疆史"视观"东北史"。此处之"边疆"，是一种宏观的大区域概念。由此凸显出东北的区域特征，以及引起我们关注的诸如民族、宗教、治安、经济开发、人口迁移及其他各种社会问题，使学术研究、调研活动更具有明确的目标和现实意义；同时，也为硕士研究生学位论文选题，拓展了更广阔的视野。近年来我们指导的硕士研究生学位论文，大多围绕以上问题的研究选定题目。最后，将调整后的研究方向，贯彻于教学当中。在原有相关课程的基础上，我们为研究生开设了"明清边疆史"课，为本科生开设了"中国边疆问题"专题选修课。尤其后一门课，历史、现实并重，通过中国边疆发展、演变的描述，让学生把握中国边疆社会的基本特征，正确认识其在中国历史与现实中的重要地位和扮演的角色。
研究方向的拓展，因缘于东北研究所的基本宗旨。这就是：第一，立足东北史研究，参与现实调研，以研究为基础，以调研为发展；第二，学术研究与教学并重，与培养人才并重。学以致用，经世致用，是宗旨的核心。为贯彻基本宗旨，本所成员除了致力于科研与教学、研究生培养工作，则明显加强了横向合作。合作单位，包括科研单位、大专院校、政府相关部门及宣传部门，在科研、教材编写、调研等各方面工作上，互有交叉。目前，各方面工作正在有序进行。
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